Alumni - PhDs/PostDocs
Hella Schwanke did her PhD at TU Braunschweig in the group of Melanie Brinkmann (P01) and during this time dived deeply into the molecular immune evasion mechanism elicited by the M35 protein of Murine Cytomegalovirus. She found that M35 dimers bind to regulatory DNA elements and interfere with recruitment of the cellular transcription factor interferon regulatory factor 3 (IRF3) to these sites. IRF3 is activated after viral infection by pattern recognition receptors (PRR) and is essential to induce antiviral gene expression. With methods such as RNAseq, SLAMseq, CHIP, and sophisticated bioinformatic analyses, Hella could show in tight collaboration with the DEEP-DV groups of Florian Erhard, Markus Landthaler, Lars Dölken, Adam Grundhoff, and Caroline Friedel that M35 interferes with expression of the type I interferon Ifnb1 as well as with other IRF3-dependent genes. By RNAseq analysis with cell lines generated from IRF3 and type I IFN receptor (IFNAR) KO mice, Hella could also generate a transcription atlas for IRF3- and IFNAR-specific cellular gene expression after PRR signaling. Her study is published in the Journal of Virology (PDF). Her deep insights into the IRF3 transcription factor were summarised in a detailed review article (PDF).
After her time in Braunschweig, Hella accepted a position as biologist in a diagnostic institute for haematological diseases which investigates patient materials for diseases of the blood and blood-forming organs.
Denise Ohnezeit started as a PhD student in Nicole Fischer’s group in P04, working on the manipulation of the host response by human polyomaviruses. Denise graduated in late summer 2022 and joined the labs of Angus Wilson and Ian Mohr at NYU, New York in summer 2023 as a postdoctoral researcher. There, Denise continues her passion for genome-wide analysis of the host response altered by chronic DNA viruses, now focusing on large nuclear DNA viruses.
Organoide sind dreidimensionale Strukturen aus Stammzellen und differenzierten Epithelzellen, die von vielen Organen kultiviert werden können, wie dem Darm, der Leber und Lunge. Während meines PhD erzeugte ich mittels CRISPR/Cas9-Multiplexing Mutanten von Darmorganoiden, um die Krebsentwicklung in einem Schweinemodell des Kolorektalcarzinoms zu untersuchen. Als Postdoc an der Medizinischen Hochschule Hannover verwende ich menschliche Organoide, um die Adenovirusinfektion und Immunantwort in diesem komplexeren Zellkultursystem zu studieren.
Mein erstes Ziel ist es die Zelltypen zu identifizieren, die eine Adenovirusinfektion ermöglichen oder als Virusreservoir dienen, die zur adenoviralen Reaktivierung nach hämatopoetischer Stammzelltransplantation (HSZT) führen könnten. Danach soll die Wirkung von Zytokinen auf die Virusreplikation und das Infektionsgeschehen zwischen Epithel- und Immunzellen untersucht werden. Das Ziel meiner Arbeit ist die Risiken der tödlich verlaufenden Virusaktivierung in HSZT-Patienten durch neue Behandlungs-möglichkeiten der Immunsuppression zu reduzieren.
Am besten entspannen kann ich mich beim Tanzen.