DEEP-DV-Hub
Der DEEP-DV-Hub bietet eine durchsuchbare und navigierbare Sammlung öffentlicher Omics-Experimente zu DNA-Viren, die im Gene Expression Omnibus (GEO) und im Sequence Read Archive (SRA) verfügbar sind, einschließlich aller Daten vom NCBI, dem European Bioinformatics Institute (EBI) und der DNA Data Bank of Japan (DDBJ). Dazu gehören Links zu Rohdaten und vorverarbeiteten Daten in öffentlichen Datenbanken.
The DEEP-DV hub is hier erhältlich: https://zenodo.org/records/13306615
Die Software zum Erstellen und Aktualisieren des öffentlichen Bereichs des DEEP-DV-Hubs und eines privaten Bereichs des DEEP-DV-Hubs für Omics-Datensätze, die in einem Labor oder einem größeren Projekt erzeugt wurden.
Der DEEP-DV Hub Creator ist verfügbar unter: https://github.com/friedel-lab/DEEP-DV-hubcreator